Master thesis Carmen over moleculaire onderzoek gewrichtsinfecties
Carmen Stoffers, analist van onze moleculaire afdeling, is druk met het afronden van haar Master Molecular Life Sciences. Voor haar afstudeerthesis sloeg ze de handen ineen met de OCON Orthopedische kliniek. Carmen: ”Voor dit project onderzoeken wij verschillende manieren van microbiologische diagnostiek bij periprothetische gewrichtsinfecties. Dit zijn infecties die kunnen optreden bij een gewrichtsprothese, zoals een knie- of heupimplantaat. Voor dit onderzoek testen wij 50 samples van ontstekingsvocht uit een knie.”
Momenteel onderzoekt onze afdeling bacteriologie patiëntmateriaal op zulke infecties met behulp van een kweek. Carmen: “We vergelijken dit met moleculaire technieken die mogelijk van toegevoegde waarde zijn voor het vaststellen van deze infecties.” Syndromic testing is één van deze methoden. Hiermee kun je tegelijkertijd meerdere ziekteverwekkers aantonen. De tweede methode is een fragmentlengte-analyse, waarmee je door de lengte van specifieke DNA-fragmenten micro-organismen kunt detecteren. De laatste testmethode is Next Generation Sequencing (NGS), waarbij je alle in het patiëntmateriaal aanwezige ziekteverwekkers aantoont. Tegelijkertijd onderzoekt de afdeling bacteriologie het materiaal volgens de gebruikelijke methode. Carmen: “We vergelijken de uitkomsten en kijken of we met de moleculaire methodes de diagnostiek kunnen verbeteren. Het uiteindelijke doel is betere informatie voor de arts-microbioloog, zodat deze in samenspraak met de orthopeed de behandeling kan optimaliseren.”
Carmen: “Ik ben nu bezig met het schrijven van mijn masterthesis. Die rond ik eind februari af. Ondertussen gaat het onderzoek door. Zodra we 50 samples onderzocht hebben evalueren we de uitkomst van het project met OCON.”